Next Generation Sequencing
Workflow ohne Excel-Tabellen digitalisieren – mit GEPADO Xpro von NEXUS / LAB
Next Generation Sequencing (NGS) oder Hochdurchsatz-Sequenzierung bezieht sich auf eine Reihe von Sequenzierungstechnologien, die es ermöglichen, Millionen von DNA- oder RNA-Molekülen parallel zu sequenzieren. Es handelt sich um eine revolutionäre Technologie, die die Genetik und Molekularbiologie transformiert hat. Im Gegensatz zur traditionellen Sanger-Sequenzierung, die nur eine DNA-Sequenz gleichzeitig sequenziert, kann NGS durch die gleichzeitige Sequenzierung von Hunderttausenden oder sogar Millionen von DNA- oder RNA-Fragmenten die Sequenzierung schneller und kosteneffektiver gestalten.
NGS wird in verschiedenen Bereichen eingesetzt, einschließlich der Entschlüsselung von Genomen, der Identifizierung von genetischen Varianten und der Untersuchung von Transkriptomen, Epigenomen und Metagenomen. Die Technologie hat auch einen wichtigen Beitrag zur personalisierten Medizin geleistet, indem sie die Identifizierung von Mutationen und Krankheitsursachen beschleunigt und damit die Diagnostik und Therapie verbessert hat.
Aber wie können wir nun mit Hilfe des laborprozessorientierten LIMS "GEPADO Xpro" solche NGS-Workflows robust und zielgerichtet abbilden?
Durch die steigenden Möglichkeiten der Medizin werden in vielen Laboren DNA- und RNA-Sequenzierungsprozesse durchgeführt. Eine Reihe von komplexen Arbeitsschritten werden dabei mit aufwändigen Tabellen in Microsoft Excel abgebildet. Meist können die LIS-Systeme die detail- und datenreichen Prozesse nicht vollständig darstellen. Mit den webbasierten modernen Laborinformationssystemen der NEXUS sind Sie hier im Vorteil! Sequenzierungsprozesse jeder Art können mit GEPADO Xpro zu 100% digital erfasst werden – von Sanger bis NGS. Das Berechnen der Pipettierschemata und das Zusammenstellen der Sequenzierläufe sowie das Erstellen der Sample Sheets erfolgt automatisch nach Ihren Vorgaben.
So können Sie mit der LIMS-Steuerung im Wetlab-Bereich zahlreiche Fehlerquellen vermeiden, die bei Papier- bzw. Excel-basierter Dokumentation möglich sind. Es werden manuelle Eingabe- und auch Kopierfehler vermieden und die Daten stehen übersichtlich und schnell zur Verfügung. Wichtige Qualitätsparameter werden direkt dem Lauf zugeordnet und sind so auch später nachprüfbar. Sie sind damit für schnell wechselnde Anforderungen in Ihrem Labor gewappnet. Die Sequenzvarianten werden sicher den klinischen Daten zugeordnet. Mit den Laborberichten aus GEPADO Xpro erfüllen Sie die aktuellen Anforderungen ohne Einschränkungen. Ein NGS-fähiges LIMS lohnt sich für Hochdurchsatzlabore, aber auch für kleinere Laboreinrichtungen.
Hierfür bietet NEXUS / LAB mit GEPADO Xpro automatisierte Reportlösungen an:
- Asservierungslokalisierungssystem für Proben
- Erstellung von Verdünnungsreihen
- Mastermix Berechnungen
- Intelligente Indix-Vergabe und Dokumentation
- Erstellung von Plate Records und Sample Sheets
Mit unseren LIMS-basierten Prozesslösungen bieten wir Ihnen individuell anpassbare Anwendungen, die Ihre Mitarbeiter/innen entlasten, sowie Sicherheit und Transparenz in der Datenverarbeitung gewährleisten. Wir beraten Sie gerne!